2026年8月5日，四川省食用菌研究所陈影研究员团队在真菌学国际顶级期刊《Fungal Diversity》（2026年IF=27，一区TOP期刊）上发表题为“Absolute-quantitative microbiome profiling identifies pathogen-sensitive windows and cross-domain assembly rules in Morchella cultivation soils”的研究论文。该研究通过引入合成内标DNA对测序数据进行校准，系统解析了六妹羊肚菌完整栽培周期中土壤细菌和真菌群落的演替规律，揭示了阶段特异性的关键病害风险窗口及跨域群落组装机制。

该研究建立了连续采样体系，创新性地采用spike-in绝对定量微生物组技术，获得每克干土中微生物基因拷贝数的真实数量，克服了传统相对丰度分析只能反映比例、无法追踪真实数量变化的局限，更准确地揭示了土壤微生物群落的动态变化。

研究表明，从播种、菌丝生长、原基形成至幼菇阶段，土壤微生物群落组成、互作网络及生态组装过程均发生剧烈变化。研究将微生物群落变化与土壤养分、水分等环境因素进行关联分析，构建了“定量丰度—群落组装—共现网络—环境关联”的综合分析框架，揭示了资源条件变化与微生物演替之间的内在联系。

值得关注的是，研究鉴定出菌丝生长至子实体幼菇发育阶段是羊肚菌栽培的关键生态敏感窗口。该时期Fusarium、Lecanicillium等潜在拮抗或风险相关真菌出现明显富集，提示此阶段需重点加强病害监测与生态调控，为建立羊肚菌栽培土壤微生物动态监测体系和病害早期预警机制奠定了重要理论基础。

该成果相当于为羊肚菌栽培土壤建立了“微生物健康档案”，明确了栽培过程中最危险的“病害敏感期”，为未来在关键生育期开展靶向微生物调控、病害风险预警及合成菌群设计提供了重要理论依据，对推动微生物组指导的羊肚菌绿色高效栽培具有重要意义。

四川省农业科学院/四川省食用菌研究所陈影研究员、电子科技大学博士研究生邓宗林、四川省农业科学院/四川省食用菌研究所曹雪莲助理研究员为论文共同第一作者，四川省农业科学院/四川省食用菌研究所谢丽源研究员、唐杰研究员为论文共同通讯作者。研究工作得到了国家食用菌产业技术体系、四川食用菌创新团队和四川省科技计划项目的资助。

论文链接：https://www.bioacad.com/article/doi.org/10.65390/fdiv.2026.136017

（省食用菌所 陈影、曹雪莲/撰稿  李小林/校对  林杨/审核）