4月6日，由生核所和作物所甘薯团队共同组织实施、国内外多家单位参与合作的题为“The wild sweetpotato (Ipomoea trifida) genome provides insights into storage root development”的研究论文在线发表在BMC Plant Biology，高质量完成了甘薯二倍体祖先种I.trifida参考基因组解析，是我院在复杂基因组研究中取得的重要进展，为深入解析重要农艺复杂性状——块根发育和淀粉积累的遗传基础以及挖掘野生种优良基因提供了宝贵的资源。

本研究采用二代加三代测序，组装出I.trifida var. Y22（高杂合，2.20%）基因组460.93 Mb，占预测基因组大小的96.71%，通过高密度遗传图谱（平均0.5 cM）将scaffold挂载到染色体水平，挂载率达86.88%（高于美国Cornell University纯合子的挂载率：80.8%）；通过比较基因组的方法分析了全基因组三倍化事件和I.trifida基因组比I.nil小的原因；进一步综合运用基因家族扩张收缩分析、QTL定位和比较转录组分析，获得一个差异表达的新基因并命名为BMY11，并初步揭示该基因与块根淀粉积累和块根膨大有关。

本研究得到了国家自然科学基金、国家甘薯产业技术体系、四川省财政创新能力提升工程、四川省农作物分子育种平台等项目的联合支持。

全文链接：

https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-019-1708-z